L’organismo istituzionale della Fondazione “Istituto Neurologico Nazionale C. Mondino” è il Comitato Etico, che si occupa delle procedure e delle valutazioni delle sperimentazioni.
Dal 1° marzo 2017 il Comitato Etico Area Referente Pavia della Fondazione IRCCS Policlinico San Matteo è competente per la valutazione dei protocolli e degli emendamenti delle sperimentazioni da svolgere presso la Fondazione Mondino (in base al Decreto dirigenziale regionale del 2013 sulla riorganizzazione dei Comitati Etici della Regione Lombardia e della deliberazione n. 4/C.d.A./0095 del 22/9/2016).